該片的故事是在2006年電影版《死亡筆記》基拉與L去世后的十年，6本死亡筆記散落人間為線索展開。追查死亡筆記的主人公三島創（東出昌大飾），與希望禁止死亡筆記和追查死亡筆記的偵探竜崎（池松壯亮飾），以及希望掌控所有死亡筆記并想"基拉"復活的瘋狂天才紫苑優輝（菅田將暉飾），構成了鐵三角，一場終極爭奪戰就此拉開，即將替死神揭開序幕。