1989年，日本。喬納森·喬斯達與DIO決戰后的一百年，DIO復活了。同時，喬瑟夫的孫子，空條承太郎發現自己有幽波紋（替身）能力，DIO的復活影響了沒有替身抵抗能力的母親，陷入病危情況；為了拯救命在旦夕的母親，承太郎與喬瑟夫出發前往DIO的所在地——埃及。